بخش «اعتقادات و پاسخ به شبهات» شامل كتاب‌ها و مقالات تخصصی مرتبط با موضوع «اعتقادات و پاسخ به شبهات» در كتابخانه تخصصی حج قابل دسترسی است.
این بخش شامل كتاب‌ها و مقالاتی است كه به همت مركز تحقیقات حج به نگارش درآمده است.

شیعه شناسی و پاسخ به شبهات به قلم علی اصغر رضوانی، شیعه پاسخ می‌دهد به قلم سید‌رضا حسینی‌نسب، آیین وهابیت به قلم جعفر سبحانی، بهاییان به قلم سید‌محمدباقر نجفی، مجموعه گفتمان‌های مذاهب اسلامی به قلم دكتر محمدتقی فخلعی، شیعه و پاسخ به چند پرسش به قلم شیخ رضا استادى، نقدی بر كتاب اهل‌بیت از خود دفاع می‌كند به قلم یوسفى صاحبى، توحید و شرك در نگاه شیعه و وهابیت به قلم احمد عابدى، فضایل اهل بیت رسول(ص) و مناقب اولاد بتول(س) به قلم عمادالدین حسن‌بن‌علی طبری برخی از عناوین كتاب‌‌های موجود در این بخش است.

صحابه در قرآن و سنت و تاریخ به قلم سیدمحسن حسینی‌فقیه، شیعه و مهدویت‏ به قلم غلامرضا رفیعى‏، سب‌المعصومین(ع) به قلم اسدالله اصالت، ‏ائمه اهل بیت(ع) به قلم سیدمحمدجواد هاشمى، تحریف قرآن‏ به قلم سیدمحمدصادق هاشمى‌شاهرودى‏، چگونگى استقرار خلافت على(ع) و كسب اجماع واقعى‏ به قلم فاطمه فقیه‌صالحى‏ برخی از عناوین مقالات این بخش است.