مؤسسه امام هادی (علیه السلام) با هدف کمک به رفع کمبودهای فرهنگی و مذهبی، در بسیاری از نقاط مستضعف جامعه شیعه بخصوص کشور افغانستان در سال (1425 هـ.ق – 1387 هـ.ش) توسط حضرت حجت الاسلام و المسلمین حاج آقای محقق غزنوی و تعدادی از عالمان دینی تأسیس گردید. با عنایات حضرت حق، در سالیانی که از تأسیس این موسسه می گذرد، توسعه بسیاری در فعالیت های مختلف این مرکز ایجاد شده که جای بسی خرسندی وتوجه را دارد.